三年后。
遍地废墟，荒无人烟。
天空乌云密布，昏昏沉沉的，一整天过去，始终不见太阳光线照耀。
曾经的高楼大厦，如今的断壁残垣内，也罕有光亮，一切都像是被黑暗吞噬了。
那是大量放射性尘埃积聚于大气之中，造就了永恒的黑夜。
审判日。
所有幸存者终生难忘的一天。
那天，多个被称作数码宝贝的未确认生命体之间似乎发生了冲突，并且展开了激战。
尽管没人知晓原因。
但在不久，经过一番混战，人造卫星透过满目疮痍的建筑群观察发现，那火红身影在某个时刻忽然消失得无影无踪。
朱雀兽死了。
一时间，几乎全人类都在庆祝，那位世界毁灭者-朱雀兽的灭亡。
然而，不知为何，不知源头，不知是谁，突如其来发动的全面核战争，彻底地摧毁了世界。
可能是乐极生悲？
一朵又一朵。
无数蘑菇云缓缓升起。
操作者得令，面无表情连续发射，库存迅速消耗殆尽。
地球喷完烟雾之后。
惊天动地的大灾变结束。
寒冷、饥饿，无情降临。
五大洲无一幸免。
紧接着，强大得离谱的家伙们粉墨登场，互相制衡，世界被划分为三股势力。
燃烧军团，主要由三位魔王组成的恶魔军队，据说与世界末日的发生有着某种联系，为首者更是被称作暗黑破坏神，比朱雀兽更加可怕，就算是多么强硬的人，听见这个名字都将瑟瑟发抖。
三位魔王一个比一个手段狠辣，稍有不爽，举手投足就能毁天灭地，令人生畏。
脚下早已是尸骸满满。
即便如此，仍然有无数人牢牢依附于燃烧军团旗下，抱着虔诚的心充当魔王的亲卫军，做牛做马，甚至甘愿无条件为恶魔献出性命，简直难以置信，这到底是为什么呢？
圣殿骑士团，成员包含了三位圣骑士，他们骁勇善战，一言一行光明磊落，专门与魔王作对，但又不像是人类的盟友，仿佛无视了人们的存在一般。
毫无疑问，向往光明的人们热衷于追寻他们的脚步，恳求圣骑士们早日扫清世界的污秽，灭掉恶魔，恢复和平带来秩序。
无论如何，前所未有的狂热崇拜，是否令这些究极体数码兽昏了头脑，真的以为自己能拯救世界，成为传说中的圣骑士了？
第三方势力，残余的人类抵抗力量，巢穴部队和反抗军的联合，拥有着迄今为止最精锐的常规武装，蜷缩在世界的各个角落，收容接纳幸存者。
全世界也许遍布了他们的踪迹，但却极难遇见，他们致力于消灭所有非人类智慧生物，所采取的攻势似乎对圣骑士和恶魔双方都显得杯水车薪。
与有着固定地盘的两个势力不同，就算有心加入，寻求庇护，也得看运气吧。
然而，就在所有人以为大局已定，天下三分之际。
“轰隆隆”
不再寂静的夏延山，竟是莫名产生了地震，新的希望不知不觉间苏醒了...